Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V6

SUPT20HL2, Putative transcription factor SPT20 homolog-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HL2P0C7V6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUPT20HL2P0C7V6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUPT20HL2P0C7V6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SUPT20HL2P0C7V6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT20HL2P0C7V6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms