Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFPTP0C1Z6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFPTP0C1Z6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFPTP0C1Z6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TFPTP0C1Z6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFPTP0C1Z6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFPTP0C1Z6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms