Protein–RNA interactions for Protein: P08047

SP1, Transcription factor Sp1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1P08047 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP1P08047 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP1P08047 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP1P08047 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP1P08047 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP1P08047 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP1P08047 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP1P08047 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP1P08047 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP1P08047 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP1P08047 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP1P08047 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP1P08047 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP1P08047 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP1P08047 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP1P08047 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP1P08047 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SP1P08047 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP1P08047 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SP1P08047 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SP1P08047 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP1P08047 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP1P08047 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP1P08047 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP1P08047 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP1P08047 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP1P08047 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP1P08047 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SP1P08047 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP1P08047 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP1P08047 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP1P08047 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP1P08047 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP1P08047 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP1P08047 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP1P08047 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP1P08047 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP1P08047 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SP1P08047 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP1P08047 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP1P08047 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP1P08047 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SP1P08047 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP1P08047 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP1P08047 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP1P08047 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP1P08047 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP1P08047 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP1P08047 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP1P08047 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SP1P08047 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP1P08047 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP1P08047 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP1P08047 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP1P08047 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP1P08047 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP1P08047 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP1P08047 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP1P08047 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP1P08047 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP1P08047 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP1P08047 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SP1P08047 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP1P08047 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP1P08047 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP1P08047 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SP1P08047 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP1P08047 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP1P08047 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SP1P08047 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP1P08047 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP1P08047 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP1P08047 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP1P08047 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP1P08047 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP1P08047 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP1P08047 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP1P08047 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SP1P08047 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP1P08047 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SP1P08047 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SP1P08047 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP1P08047 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SP1P08047 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP1P08047 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP1P08047 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms