Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN1P07384 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN1P07384 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN1P07384 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms