Protein–RNA interactions for Protein: P05156

CFI, Complement factor I, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFIP05156 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFIP05156 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFIP05156 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFIP05156 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFIP05156 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFIP05156 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFIP05156 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFIP05156 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFIP05156 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFIP05156 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFIP05156 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFIP05156 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CFIP05156 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFIP05156 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFIP05156 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFIP05156 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFIP05156 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFIP05156 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFIP05156 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFIP05156 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFIP05156 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFIP05156 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFIP05156 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFIP05156 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFIP05156 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFIP05156 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFIP05156 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFIP05156 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFIP05156 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFIP05156 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFIP05156 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFIP05156 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFIP05156 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFIP05156 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFIP05156 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFIP05156 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CFIP05156 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFIP05156 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFIP05156 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFIP05156 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFIP05156 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFIP05156 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFIP05156 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFIP05156 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFIP05156 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFIP05156 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFIP05156 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFIP05156 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFIP05156 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CFIP05156 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFIP05156 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFIP05156 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFIP05156 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFIP05156 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFIP05156 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFIP05156 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFIP05156 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFIP05156 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CFIP05156 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFIP05156 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFIP05156 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CFIP05156 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFIP05156 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFIP05156 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFIP05156 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CFIP05156 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFIP05156 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFIP05156 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CFIP05156 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CFIP05156 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFIP05156 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CFIP05156 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFIP05156 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFIP05156 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFIP05156 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFIP05156 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFIP05156 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFIP05156 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFIP05156 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFIP05156 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFIP05156 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFIP05156 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFIP05156 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFIP05156 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFIP05156 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFIP05156 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFIP05156 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFIP05156 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFIP05156 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFIP05156 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CFIP05156 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFIP05156 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFIP05156 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFIP05156 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFIP05156 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFIP05156 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFIP05156 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFIP05156 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFIP05156 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFIP05156 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms