Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
IFNW1P05000 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNW1P05000 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNW1P05000 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms