Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P04436 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P04436 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P04436 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P04436 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P04436 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P04436 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P04436 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P04436 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P04436 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P04436 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P04436 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P04436 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P04436 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P04436 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P04436 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P04436 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P04436 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P04436 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
P04436 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P04436 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P04436 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P04436 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P04436 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
P04436 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P04436 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P04436 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P04436 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P04436 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P04436 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
P04436 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P04436 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P04436 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P04436 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
P04436 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
P04436 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P04436 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P04436 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P04436 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P04436 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P04436 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P04436 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P04436 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P04436 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P04436 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
P04436 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P04436 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P04436 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P04436 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P04436 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P04436 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P04436 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P04436 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04436 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04436 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04436 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04436 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04436 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04436 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04436 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04436 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04436 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04436 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04436 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P04436 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P04436 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P04436 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04436 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04436 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04436 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04436 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
P04436 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04436 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04436 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P04436 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P04436 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P04436 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P04436 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P04436 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P04436 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P04436 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P04436 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P04436 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P04436 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P04436 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P04436 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P04436 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P04436 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
P04436 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
P04436 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P04436 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P04436 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P04436 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P04436 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P04436 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P04436 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04436 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04436 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04436 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04436 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms