Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OPN1SWP03999 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPN1SWP03999 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1SWP03999 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPN1SWP03999 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPN1SWP03999 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPN1SWP03999 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OPN1SWP03999 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms