Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
F9P00740 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
F9P00740 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
F9P00740 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
F9P00740 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
F9P00740 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
F9P00740 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
F9P00740 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
F9P00740 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
F9P00740 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
F9P00740 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
F9P00740 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
F9P00740 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
F9P00740 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
F9P00740 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
F9P00740 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
F9P00740 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
F9P00740 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
F9P00740 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
F9P00740 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
F9P00740 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
F9P00740 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
F9P00740 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
F9P00740 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
F9P00740 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F9P00740 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
F9P00740 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
F9P00740 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
F9P00740 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F9P00740 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F9P00740 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F9P00740 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
F9P00740 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F9P00740 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
F9P00740 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
F9P00740 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
F9P00740 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
F9P00740 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
F9P00740 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F9P00740 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
F9P00740 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
F9P00740 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
F9P00740 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F9P00740 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F9P00740 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
F9P00740 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F9P00740 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
F9P00740 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
F9P00740 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
F9P00740 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
F9P00740 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
F9P00740 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
F9P00740 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
F9P00740 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
F9P00740 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
F9P00740 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
F9P00740 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
F9P00740 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
F9P00740 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
F9P00740 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
F9P00740 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
F9P00740 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
F9P00740 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F9P00740 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F9P00740 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F9P00740 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
F9P00740 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F9P00740 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
F9P00740 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
F9P00740 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
F9P00740 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
F9P00740 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
F9P00740 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
F9P00740 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
F9P00740 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
F9P00740 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
F9P00740 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
F9P00740 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
F9P00740 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
F9P00740 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
F9P00740 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
F9P00740 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
F9P00740 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
F9P00740 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
F9P00740 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
F9P00740 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
F9P00740 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
F9P00740 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
F9P00740 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
F9P00740 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
F9P00740 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
F9P00740 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
F9P00740 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
F9P00740 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
F9P00740 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
F9P00740 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
F9P00740 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
F9P00740 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
F9P00740 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
F9P00740 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms