Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC24AO95486 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24AO95486 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms