Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX3O95343 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX3O95343 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX3O95343 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX3O95343 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX3O95343 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX3O95343 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX3O95343 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX3O95343 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX3O95343 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX3O95343 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX3O95343 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX3O95343 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX3O95343 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX3O95343 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX3O95343 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX3O95343 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX3O95343 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX3O95343 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX3O95343 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX3O95343 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX3O95343 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX3O95343 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX3O95343 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIX3O95343 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX3O95343 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX3O95343 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX3O95343 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX3O95343 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX3O95343 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX3O95343 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX3O95343 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX3O95343 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX3O95343 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX3O95343 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX3O95343 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX3O95343 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX3O95343 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX3O95343 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX3O95343 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX3O95343 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX3O95343 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX3O95343 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX3O95343 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX3O95343 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX3O95343 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX3O95343 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX3O95343 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX3O95343 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX3O95343 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX3O95343 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX3O95343 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX3O95343 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX3O95343 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX3O95343 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX3O95343 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX3O95343 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX3O95343 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX3O95343 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX3O95343 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX3O95343 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX3O95343 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX3O95343 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX3O95343 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX3O95343 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX3O95343 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX3O95343 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX3O95343 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX3O95343 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX3O95343 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX3O95343 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX3O95343 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX3O95343 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX3O95343 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX3O95343 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX3O95343 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX3O95343 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX3O95343 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX3O95343 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX3O95343 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX3O95343 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX3O95343 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX3O95343 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX3O95343 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX3O95343 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX3O95343 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX3O95343 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX3O95343 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX3O95343 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIX3O95343 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIX3O95343 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX3O95343 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX3O95343 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX3O95343 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX3O95343 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX3O95343 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX3O95343 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX3O95343 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX3O95343 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX3O95343 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms