Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCB11O95342 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCB11O95342 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCB11O95342 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 301.1 ms