Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF4AO95239 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIF4AO95239 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIF4AO95239 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms