Protein–RNA interactions for Protein: O94941

UBOX5, RING finger protein 37, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBOX5O94941 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBOX5O94941 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBOX5O94941 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBOX5O94941 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBOX5O94941 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms