Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK2AP2O75956 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK2AP2O75956 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK2AP2O75956 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK2AP2O75956 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK2AP2O75956 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK2AP2O75956 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK2AP2O75956 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK2AP2O75956 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK2AP2O75956 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK2AP2O75956 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK2AP2O75956 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK2AP2O75956 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK2AP2O75956 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK2AP2O75956 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms