Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPM1BO75688 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPM1BO75688 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms