Protein–RNA interactions for Protein: O75679

RFPL3, Ret finger protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3O75679 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFPL3O75679 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFPL3O75679 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms