Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSDE1O75534 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSDE1O75534 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSDE1O75534 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSDE1O75534 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CSDE1O75534 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSDE1O75534 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSDE1O75534 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSDE1O75534 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CSDE1O75534 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSDE1O75534 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSDE1O75534 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CSDE1O75534 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CSDE1O75534 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSDE1O75534 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSDE1O75534 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSDE1O75534 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CSDE1O75534 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CSDE1O75534 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSDE1O75534 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSDE1O75534 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSDE1O75534 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSDE1O75534 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CSDE1O75534 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CSDE1O75534 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSDE1O75534 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSDE1O75534 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSDE1O75534 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSDE1O75534 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSDE1O75534 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms