Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSCO60682 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSCO60682 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSCO60682 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSCO60682 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSCO60682 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSCO60682 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MSCO60682 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MSCO60682 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MSCO60682 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MSCO60682 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MSCO60682 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MSCO60682 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MSCO60682 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MSCO60682 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MSCO60682 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MSCO60682 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MSCO60682 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MSCO60682 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MSCO60682 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MSCO60682 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MSCO60682 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MSCO60682 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MSCO60682 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MSCO60682 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MSCO60682 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MSCO60682 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MSCO60682 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MSCO60682 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSCO60682 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSCO60682 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSCO60682 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSCO60682 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSCO60682 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MSCO60682 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSCO60682 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSCO60682 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSCO60682 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSCO60682 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSCO60682 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MSCO60682 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MSCO60682 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSCO60682 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSCO60682 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSCO60682 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSCO60682 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSCO60682 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
MSCO60682 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MSCO60682 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSCO60682 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSCO60682 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MSCO60682 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSCO60682 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSCO60682 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSCO60682 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSCO60682 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSCO60682 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSCO60682 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSCO60682 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSCO60682 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSCO60682 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MSCO60682 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSCO60682 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSCO60682 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MSCO60682 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSCO60682 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSCO60682 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSCO60682 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MSCO60682 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSCO60682 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSCO60682 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSCO60682 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSCO60682 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MSCO60682 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MSCO60682 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MSCO60682 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MSCO60682 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MSCO60682 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSCO60682 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSCO60682 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSCO60682 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSCO60682 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSCO60682 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSCO60682 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSCO60682 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSCO60682 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSCO60682 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSCO60682 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSCO60682 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSCO60682 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSCO60682 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSCO60682 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSCO60682 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSCO60682 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSCO60682 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSCO60682 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSCO60682 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MSCO60682 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MSCO60682 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSCO60682 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms