Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSNA1O43805 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSNA1O43805 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSNA1O43805 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSNA1O43805 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSNA1O43805 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSNA1O43805 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSNA1O43805 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSNA1O43805 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSNA1O43805 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SSNA1O43805 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSNA1O43805 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSNA1O43805 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms