Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN6O43657 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSPAN6O43657 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN6O43657 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms