Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF12O43508 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF12O43508 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12O43508 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF12O43508 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms