Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP26A1O43174 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP26A1O43174 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP26A1O43174 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP26A1O43174 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP26A1O43174 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP26A1O43174 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP26A1O43174 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP26A1O43174 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP26A1O43174 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP26A1O43174 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP26A1O43174 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP26A1O43174 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP26A1O43174 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms