Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LINC01565O15544 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC01565O15544 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC01565O15544 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 370.2 ms