Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHOX2AO14813 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2AO14813 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms