Protein–RNA interactions for Protein: O14593

RFXANK, DNA-binding protein RFXANK, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXANKO14593 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RFXANKO14593 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFXANKO14593 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXANKO14593 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFXANKO14593 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFXANKO14593 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFXANKO14593 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFXANKO14593 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFXANKO14593 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFXANKO14593 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFXANKO14593 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFXANKO14593 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RFXANKO14593 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFXANKO14593 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms