Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TXNDC9O14530 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC9O14530 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC9O14530 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms