Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAD1O00515 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAD1O00515 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAD1O00515 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAD1O00515 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAD1O00515 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LAD1O00515 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LAD1O00515 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAD1O00515 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAD1O00515 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAD1O00515 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAD1O00515 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAD1O00515 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAD1O00515 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAD1O00515 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAD1O00515 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAD1O00515 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAD1O00515 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAD1O00515 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LAD1O00515 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAD1O00515 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAD1O00515 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAD1O00515 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAD1O00515 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAD1O00515 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAD1O00515 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LAD1O00515 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LAD1O00515 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAD1O00515 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAD1O00515 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAD1O00515 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAD1O00515 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAD1O00515 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAD1O00515 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAD1O00515 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAD1O00515 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAD1O00515 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAD1O00515 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAD1O00515 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAD1O00515 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAD1O00515 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LAD1O00515 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAD1O00515 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAD1O00515 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAD1O00515 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAD1O00515 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAD1O00515 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAD1O00515 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAD1O00515 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAD1O00515 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAD1O00515 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAD1O00515 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAD1O00515 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAD1O00515 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAD1O00515 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAD1O00515 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAD1O00515 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAD1O00515 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAD1O00515 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAD1O00515 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAD1O00515 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAD1O00515 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAD1O00515 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAD1O00515 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAD1O00515 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAD1O00515 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAD1O00515 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAD1O00515 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LAD1O00515 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAD1O00515 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAD1O00515 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAD1O00515 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAD1O00515 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAD1O00515 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAD1O00515 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAD1O00515 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LAD1O00515 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAD1O00515 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAD1O00515 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAD1O00515 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAD1O00515 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAD1O00515 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAD1O00515 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAD1O00515 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAD1O00515 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAD1O00515 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAD1O00515 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAD1O00515 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAD1O00515 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAD1O00515 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAD1O00515 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAD1O00515 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAD1O00515 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAD1O00515 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAD1O00515 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAD1O00515 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAD1O00515 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAD1O00515 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAD1O00515 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAD1O00515 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms