Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVH48-1M5A8F1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVH48-1M5A8F1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms