Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
H7C1W4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
H7C1W4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
H7C1W4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
H7C1W4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
H7C1W4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
H7C1W4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
H7C1W4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
H7C1W4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
H7C1W4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
H7C1W4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
H7C1W4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
H7C1W4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
H7C1W4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
H7C1W4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
H7C1W4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
H7C1W4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
H7C1W4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
H7C1W4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
H7C1W4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
H7C1W4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
H7C1W4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
H7C1W4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
H7C1W4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
H7C1W4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
H7C1W4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
H7C1W4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
H7C1W4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
H7C1W4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
H7C1W4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
H7C1W4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
H7C1W4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
H7C1W4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
H7C1W4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
H7C1W4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
H7C1W4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
H7C1W4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
H7C1W4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
H7C1W4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
H7C1W4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
H7C1W4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
H7C1W4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
H7C1W4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
H7C1W4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
H7C1W4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
H7C1W4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
H7C1W4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
H7C1W4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
H7C1W4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
H7C1W4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
H7C1W4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
H7C1W4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
H7C1W4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
H7C1W4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
H7C1W4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
H7C1W4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
H7C1W4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
H7C1W4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
H7C1W4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
H7C1W4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
H7C1W4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
H7C1W4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
H7C1W4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
H7C1W4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
H7C1W4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
H7C1W4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
H7C1W4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
H7C1W4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
H7C1W4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
H7C1W4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
H7C1W4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
H7C1W4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
H7C1W4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
H7C1W4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
H7C1W4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
H7C1W4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
H7C1W4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
H7C1W4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
H7C1W4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
H7C1W4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
H7C1W4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
H7C1W4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
H7C1W4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
H7C1W4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
H7C1W4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
H7C1W4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
H7C1W4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
H7C1W4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
H7C1W4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
H7C1W4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
H7C1W4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
H7C1W4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
H7C1W4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
H7C1W4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
H7C1W4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
H7C1W4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
H7C1W4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
H7C1W4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
H7C1W4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
H7C1W4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms