Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IQCJ-SCHIP1C9J366 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IQCJ-SCHIP1C9J366 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.8 ms