Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPBD1B2RD01 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms