Protein–RNA interactions for Protein: A8K7I4

CLCA1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA1A8K7I4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLCA1A8K7I4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA1A8K7I4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA1A8K7I4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA1A8K7I4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms