Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC69A6NI79 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC69A6NI79 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC69A6NI79 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms