Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf118A6NHY6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf118A6NHY6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms