Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
POTEFA5A3E0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
POTEFA5A3E0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POTEFA5A3E0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms