Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC66A2RUB6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC66A2RUB6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC66A2RUB6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms