Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMX2A2RU54 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HMX2A2RU54 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMX2A2RU54 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMX2A2RU54 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms