Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC78A2IDD5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC78A2IDD5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC78A2IDD5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC78A2IDD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms