Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIPSLA2A3N6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIPSLA2A3N6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms