Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA6A0AVT1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA6A0AVT1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms