Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms