Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms