Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN3Q9UPQ7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms