Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PNMA8BQ9ULN7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms