Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms