Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms