Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID2Q9UJV3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MID2Q9UJV3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms