Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP25Q9UHP3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms