Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms